Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Hoxd1Q01822 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm25089-201ENSMUST00000102015 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm25840-201ENSMUST00000177821 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm24952-201ENSMUST00000177909 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm24926-201ENSMUST00000178053 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm23682-201ENSMUST00000178146 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm24652-201ENSMUST00000178223 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm22632-201ENSMUST00000178266 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm22629-201ENSMUST00000178272 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm24021-201ENSMUST00000178435 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm22274-201ENSMUST00000178441 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm22050-201ENSMUST00000178442 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm23688-201ENSMUST00000178502 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm23944-201ENSMUST00000178607 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm26283-201ENSMUST00000178625 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm25452-201ENSMUST00000178776 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm23286-201ENSMUST00000178963 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm22640-201ENSMUST00000179035 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm25984-201ENSMUST00000179129 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm25585-201ENSMUST00000179469 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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