Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Vpreb1P13372 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms