Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
DffaO54786 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
DffaO54786 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
DffaO54786 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
DffaO54786 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DffaO54786 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DffaO54786 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DffaO54786 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DffaO54786 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DffaO54786 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DffaO54786 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DffaO54786 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DffaO54786 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DffaO54786 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
DffaO54786 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
DffaO54786 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
DffaO54786 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
DffaO54786 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
DffaO54786 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.92□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
DffaO54786 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
DffaO54786 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
DffaO54786 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
DffaO54786 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
DffaO54786 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
DffaO54786 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
DffaO54786 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
DffaO54786 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
DffaO54786 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
DffaO54786 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
DffaO54786 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms