Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
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Zfp558E9Q1J0 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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Zfp558E9Q1J0 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.24□□□□□ -2.45
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Zfp558E9Q1J0 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
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Zfp558E9Q1J0 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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Zfp558E9Q1J0 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.8 ms