Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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Trabd2bB1ATG9 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.19□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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Trabd2bB1ATG9 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
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Trabd2bB1ATG9 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Trabd2bB1ATG9 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Trabd2bB1ATG9 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Trabd2bB1ATG9 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Trabd2bB1ATG9 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Trabd2bB1ATG9 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Trabd2bB1ATG9 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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Trabd2bB1ATG9 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Trabd2bB1ATG9 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Trabd2bB1ATG9 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Trabd2bB1ATG9 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Trabd2bB1ATG9 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Trabd2bB1ATG9 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
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Trabd2bB1ATG9 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Trabd2bB1ATG9 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC0.12□□□□□ -2.39
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Trabd2bB1ATG9 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Trabd2bB1ATG9 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1652.3 ms