Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Mir1950-201ENSMUST00000158526 74 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
Spocd1B1ASB6 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm24674-201ENSMUST00000179194 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Spocd1B1ASB6 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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