Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rtf1A2AQ19 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Rtf1A2AQ19 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rtf1A2AQ19 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.8 ms