Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rabgef1Q9JM13 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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