Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtaQ9JHK4 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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