Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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Ccdc39Q9D5Y1 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc39Q9D5Y1 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc39Q9D5Y1 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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