Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Zbed3Q9D0L1 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms