Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Shmt2Q9CZN7 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Shmt2Q9CZN7 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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