Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Rprd1bQ9CSU0 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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