Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Mir7651-201ENSMUST00000184154 64 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC-0.9□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.9□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm25249-201ENSMUST00000175471 78 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
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