Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ttf2Q5NC05 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ttf2Q5NC05 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ttf2Q5NC05 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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