Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 Gm24378-201ENSMUST00000122699 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Gm28047Q3US59 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm23630-201ENSMUST00000175292 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Gm28047Q3US59 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 230 ms