Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ctu2Q3U308 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ctu2Q3U308 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ctu2Q3U308 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ctu2Q3U308 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ctu2Q3U308 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ctu2Q3U308 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ctu2Q3U308 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ctu2Q3U308 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ctu2Q3U308 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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