Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
Trim71Q1PSW8 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Trim71Q1PSW8 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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