Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
ptchd1Q14B62 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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