Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.34
Rpusd3Q14AI6 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Rpusd3Q14AI6 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.8 ms