Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Hoxd1Q01822 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd1Q01822 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
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