Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtbP53612 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RabggtbP53612 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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