Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Rpl28P41105 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Rpl28P41105 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms