Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PtprmP28828 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
PtprmP28828 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PtprmP28828 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PtprmP28828 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PtprmP28828 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Mir3101-201ENSMUST00000175607 88 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm25847-201ENSMUST00000116793 96 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PtprmP28828 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
PtprmP28828 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PtprmP28828 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PtprmP28828 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PtprmP28828 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PtprmP28828 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PtprmP28828 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PtprmP28828 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PtprmP28828 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
PtprmP28828 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PtprmP28828 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PtprmP28828 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PtprmP28828 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PtprmP28828 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
PtprmP28828 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PtprmP28828 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PtprmP28828 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PtprmP28828 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
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