Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
DffaO54786 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
DffaO54786 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
DffaO54786 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
DffaO54786 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
DffaO54786 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
DffaO54786 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
DffaO54786 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
DffaO54786 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
DffaO54786 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
DffaO54786 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
DffaO54786 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
DffaO54786 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
DffaO54786 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
DffaO54786 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DffaO54786 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-0.76□□□□□ -2.53
DffaO54786 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DffaO54786 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DffaO54786 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DffaO54786 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DffaO54786 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DffaO54786 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DffaO54786 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
DffaO54786 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
DffaO54786 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
DffaO54786 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
DffaO54786 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
DffaO54786 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
DffaO54786 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
DffaO54786 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
DffaO54786 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DffaO54786 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DffaO54786 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
DffaO54786 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
DffaO54786 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
DffaO54786 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
DffaO54786 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DffaO54786 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DffaO54786 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DffaO54786 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
DffaO54786 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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