Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Eftud2O08810 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Eftud2O08810 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Eftud2O08810 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Eftud2O08810 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Eftud2O08810 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Eftud2O08810 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Eftud2O08810 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Eftud2O08810 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Eftud2O08810 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Eftud2O08810 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms