Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Gm5407E9Q7Q1 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm5407E9Q7Q1 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.3 ms