Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
Zfp558E9Q1J0 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Zfp558E9Q1J0 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 368 ms