Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Trabd2bB1ATG9 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Trabd2bB1ATG9 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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