Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms