Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Krt27Q9Z320 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Krt27Q9Z320 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Krt27Q9Z320 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Krt27Q9Z320 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt27Q9Z320 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms