Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms