Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms