Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms