Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms