Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccne2Q9Z238 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms