Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip6Q9Z1Y4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms