Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms