Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Nfe2l3Q9WTM4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Nfe2l3Q9WTM4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
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Nfe2l3Q9WTM4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Nfe2l3Q9WTM4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Nfe2l3Q9WTM4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Nfe2l3Q9WTM4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Nfe2l3Q9WTM4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2l3Q9WTM4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nfe2l3Q9WTM4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nfe2l3Q9WTM4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nfe2l3Q9WTM4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nfe2l3Q9WTM4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nfe2l3Q9WTM4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nfe2l3Q9WTM4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2l3Q9WTM4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2l3Q9WTM4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2l3Q9WTM4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2l3Q9WTM4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2l3Q9WTM4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2l3Q9WTM4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2l3Q9WTM4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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Nfe2l3Q9WTM4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Nfe2l3Q9WTM4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms