Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TapbpQ9R233 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms