Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms