Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NrkQ9R0G8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NrkQ9R0G8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NrkQ9R0G8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NrkQ9R0G8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NrkQ9R0G8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NrkQ9R0G8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NrkQ9R0G8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NrkQ9R0G8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms