Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms