Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf346Q9R0B7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms