Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek3Q9R0A5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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