Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms