Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms