Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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