Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms