Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms